扁平疣的好发部位为颜面和手背，但是扁平疣也会长在身体的其他部位，如阴部，男性的阴囊和阴茎的包皮上都有出现扁平疣的可能性，专家强调说，如果生殖器官出现扁平疣的话需要尽快的治疗，以免传染给妻子及其他性伴侣扁平疣是由人类乳头瘤病毒引起的大多数都是突然出现，一般为针头至米粒大或稍大的扁平丘疹，呈圆形或不规则形，略高于皮肤表面，也可显著地突起而形成圆顶状表面光滑，境界清楚，触之较硬，为浅褐或灰白，淡黄或正常皮色

扁平疣和常见的汗管瘤易相混淆，汗管瘤又称汗管囊瘤或汗管囊肿腺瘤现已证明为一种向汗管分化的小汗腺肿瘤，以常染色体显性遗传方式遗传汗管瘤的皮肤损害主要分布在眼睑附近，皮疹呈密集分布的淡黄色或肤色丘疹，表面有蜡样光泽，半球形而扁平疣多发于面颊及手背，皮疹为扁平丘疹